В начале октября 1945 г. у И.В. Сталина произошел первый инсульт, он на два с половиной месяца выпал из активной государственной работы и вернулся в Москву только в середине декабря 1945 г., где фактическое руководство страной осуществлял его первый заместитель по правительству В.М. Молотов. По сохранившимся письмам И.В. Сталина, адресованных «триумвирату» в составе Л.П. Берия, Г.М. Маленкова и А.И. Микояна, стало очевидным, что дряхлеющий вождь был крайне недоволен поведением В.М. Молотова в отношениях с бывшими союзниками и прямо обвинил его в том, что он «не очень дорожит интересами государства и нашего правительства» и своим поведением пытается «добиться популярности среди некоторых иностранных кругов». Более того, в одном из своих посланий И.В. Сталин дал прямо понять, что не верит «в добросовестность ряда близких к нему людей», т.е. его жены и старого партийного работника П.С. Жемчужиной, которая с момента создания Еврейского антифашистского комитета была его негласным куратором. Таким образом, впервые после окончания войны И.В. Сталин поставил под сомнение авторитет самого близкого и верного своего соратника, который в глазах всего советского народа рассматривался как прямой его преемник и продолжатель дела вождя.
В конце 1945 г. состоялось новое заседание Политбюро, на котором И.В. Сталин попытался восстановить прежний еженедельный порядок его заседаний, принятый еще при В.И. Ленине и сохранявшийся до войны. По мнению ряда историков (Ю. Жуков), это предложение фактически было отклонено, и вся полнота партийной и государственной власти сосредоточилась в руках так называемой Комиссии Политбюро ЦК, или «шестерки» в составе И.В. Сталина, В.М. Молотова, Л.П. Берия, Г.М. Маленкова, А.А. Жданова и А.И. Микояна.
В марте 1946 г. на организационном Пленуме ЦК были сделаны крупные перестановки в высшем партийном руководстве:
• ввиду тяжелой болезни из состава Политбюро был выведен М.И. Калинин, а его полноправными членами стали Л.П. Берия и Г.М. Маленков;
• кандидатами в члены Политбюро были избраны Н.А. Булганин и А.Н. Косыгин;
• в состав Секретариата ЦК вошли И.В. Сталин, А.А. Жданов, Г.М. Маленков, А.А. Кузнецов и Г.М. Попов;
• внутри аппарата ЦК ВКП(б) окончательно упразднялись все отраслевые отделы и сохранялись только Управление кадров (А.А. Кузнецов) и Управление агитации и пропаганды (А.А. Жданов), а также два отдела — Организационно-инструкционный (Н.С. Патоличев) и По связям с зарубежными компартиями (М.А. Суслов);
• руководство всей оперативной работой Оргбюро и Секретариата ЦК возлагалось на А.А. Кузнецова, который де-факто стал вторым секретарем ЦК.
После завершения работы Пленума ЦК состоялась первая сессия Верховного Совета СССР 2-го созыва, на которой:
• Совет Народных Комиссаров СССР был преобразован в Совет Министров СССР, председателем которого был назначен И.В. Сталин;
• заместителями председателя Совета Министров СССР были назначены В.М. Молотов, Л.П. Берия, К.Е. Ворошилов, Н.А. Вознесенский, А.И. Микоян, А.А. Андреев и А.Н. Косыгин;
• секретным постановлением было образовано единое Бюро Совета Министров СССР во главе с Л.П. Берия и его заместителями Н.А. Вознесенским и А.Н. Косыгиным;
• председателем Президиума Верховного Совета СССР был назначен Н.М. Шверник, а многолетний всероссийский староста М.И. Калинин, занимавший пост главы советского государства почти 27 лет, с почетом был отправлен в отставку и вскоре умер от рака желудка.
Все эти перестановки, по мнению рада авторов (Ю. Жуков), говорили о том, что:
1) Л.П. Берия стал фактическим главой правительства;
2) В.М. Молотов утратил прежние позиции второго человека в партии и государстве;
3) Г.М. Маленков, потеряв ключевую должность начальника Управления кадров ЦК, перестал быть вторым секретарем ЦК;
4) И.В. Сталин, озабоченный проблемой своего преемника, сделал ставку на самого молодого члена высшего партийного руководства А.А. Кузнецова, который с поста первого секретаря Ленинградского горкома и обкома партии был переведен в Москву на должность секретаря ЦК.
Тогда же, весной 1946 г., стало активно раскручиваться так называемое «дело авиаторов», невольными инициатором которого стал сын вождя генерал-майор авиации В.И. Сталин и известный авиаконструктор генерал-полковник авиации А.С. Яковлев, передавшие вождю письмо о плачевном состоянии военной авиации и высокой аварийности новых самолетов. В результате этой «интриги» были арестованы главком ВВС РККА главный маршал авиации А.А. Новиков, главком ВВС ДВО маршал авиации С.А. Худяков и нарком авиационной промышленности генерал-полковник А.И. Шахурин.
Тень этих арестов тут же пала на секретаря ЦК ВКП(б) Г.М. Маленкова, который со времен войны курировал работу всей авиапромышленности страны, и главкома сухопутных войск, заместителя министра вооруженных сил СССР маршала Г.К. Жукова, на которого маршал авиации А.А. Новиков дал показания о подготовке им военного переворота. Одновременно были арестованы несколько десятков генералов и офицеров Группы советских войск в Германии, в том числе близкие к Г.К. Жукову генерал-лейтенанты К.Ф. Телегин и В.В. Крюков, вполне правомерно обвиненные в нецелевой растрате армейских фондов и вывозе с оккупированных территорий огромного количества дорогой старинной мебели, картин, гобеленов, столового серебра и драгоценностей.
В начале июня 1946 г. состоялся разбор «дела Жукова» на заседании Высшего военного совета, в котором приняли участие все члены Политбюро и высший генералитет страны. Обвинения против главкома сухопутных войск поддержали многие члены Политбюро, в том числе В.М. Молотов, Г.М. Маленков и А.А. Жданов. Однако ряд видных советских полководцев, в том числе маршалы И.С. Конев, A.М. Василевский, К.К. Рокоссовский и П.С. Рыбалко, отметив личные недостатки Г.К. Жукова и крупные ошибки в его работе, твердо заявили, что он является настоящим патриотом страны и не может быть организатором военного заговора.